Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VegfaQ00731 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms