Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pax8Q00288 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms