Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psmb4P99026 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms