Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casp7P97864 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp7P97864 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms