Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smyd1P97443 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms