Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
PrkdcP97313 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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