Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll3P85442 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms