Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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