Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Arf1P84078 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Arf1P84078 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Arf1P84078 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Arf1P84078 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Arf1P84078 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Arf1P84078 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms