Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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TgfbiP82198 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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TgfbiP82198 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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TgfbiP82198 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TgfbiP82198 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms