Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gabpb2P81069 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gabpb2P81069 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms