Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Otx1P80205 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms