Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ldb1P70662 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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