Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rad50P70388 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad50P70388 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rad50P70388 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms