Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf6P70279 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf6P70279 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Surf6P70279 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms