Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NficP70255 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NficP70255 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NficP70255 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NficP70255 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NficP70255 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NficP70255 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NficP70255 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NficP70255 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NficP70255 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NficP70255 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms