Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcbP68404 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcbP68404 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms