Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Acta1P68134 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms