Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snrpd3P62320 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms