Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ufm1P61961 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ufm1P61961 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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