Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Depdc5P61460 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Depdc5P61460 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms