Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd6P61407 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd6P61407 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms