Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Abce1P61222 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Abce1P61222 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Abce1P61222 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abce1P61222 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abce1P61222 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Abce1P61222 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Abce1P61222 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms