Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snap25P60879 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms