Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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CirbpP60824 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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CirbpP60824 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CirbpP60824 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms