Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nphp4P59240 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms