Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarf2P59222 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarf2P59222 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms