Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Senp1P59110 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms