Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
P58686 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
P58686 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
P58686 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms