Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Samsn1P57725 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms