Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp5P56399 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp5P56399 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp5P56399 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp5P56399 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms