Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp1P56183 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1P56183 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms