Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NcanP55066 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NcanP55066 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NcanP55066 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NcanP55066 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NcanP55066 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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