Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClgnP52194 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms