Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apobec1P51908 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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