Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a1P51906 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a1P51906 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms