Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TubP50586 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TubP50586 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TubP50586 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TubP50586 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TubP50586 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TubP50586 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TubP50586 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TubP50586 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TubP50586 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms