Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Srp9P49962 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms