Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hcls1P49710 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hcls1P49710 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms