Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PtpreP49446 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PtpreP49446 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PtpreP49446 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms