Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnni3P48787 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms