Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cox8bP48772 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms