Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rfx2P48379 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rfx2P48379 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms