Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccr7P47774 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccr7P47774 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr7P47774 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr7P47774 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr7P47774 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr7P47774 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr7P47774 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccr7P47774 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccr7P47774 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccr7P47774 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms