Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rph3aP47708 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rph3aP47708 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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