Protein–RNA interactions for Protein: P43028

Gdf6, Growth/differentiation factor 6, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf6P43028 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gdf6P43028 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gdf6P43028 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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