Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rpl28P41105 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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