Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik2P39087 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms