Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HmgclP38060 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms