Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ly6dP35459 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ly6dP35459 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms